Door 12: Is AI the solution to overcome the challenges in sequencing genomes?

In 2018, Lewin et al proposed the ambitious goal to sequence a reference genome of each eukaryotic species on Earth within 10 years called the moonshot of biology. This proposal let to the establishment of the Earth Biogenome Project (EBP) and gained a lot of traction and momentum […]

Dør 12: Er KI løsningen for å overvinne utfordringene ved sekvensering av genomer?

I 2018 foreslo Lewin et al det ambisiøse målet å sekvensere et referansegenom for hver eukaryotisk art på jorden innen 10 år, kalt «moonshot of biology». Dette forslaget førte til etableringen av Earth Biogenome Project (EBP), som fikk stor oppmerksomhet og fart i etterkant. Dette førte til etableringen […]

The second of its kind – reference genome of a lamp shall

A couple of days ago we published the genome of a brachiopod species, in specific Discradisca antillarum in the journal G3. Brachiopods are a group of shelled, filter-feeding marine invertebrates also known as lamp shalls. Though they superficially resemble bivalve mollusks, brachiopods are not. Brachiopods have the shells […]

Den andre i sitt slag – referansegenomet til en armfoting

For et par dager siden publiserte vi genomet til en armfotinger, nærmere bestemt Discradisca antillarum, i tidsskriftet G3. Brakiopoder er en gruppe skallede, filterfôrende marine virvelløse dyr, også kjent som armfotinger. Selv om de overfladisk ligner på muslinger, er brakiopoder ikke det. Brakiopoder har skall på rygg- og […]

Månedens gruppe: Begermarker (Kamptozoa eller Entoprocta)

Rekke Entoprocta (også kalt Kamptozoa) er kjent som begermark. Globalt er det kjent 260 arter til dags dato, og 30 i Norge. Individene er små, med en kroppsstørrelse på 0,5–7 mm. Imidlertid bygger andre arter, i tillegg til solitære arter, kolonier som kan bli opptil 25 cm store. […]

Group of the months: The nicking worms (Kamptozoa or Entoprocta)

The phylum Entoprocta (also called Kamptozoa) are known as the nicking worm. Globally, 260 species are known to date and 30 in Norway. The individuals are small with a body size of 0.5 – 7 mm. However, besides solitary species, other species build colonies and these can be […]

Blanding av genomet eller ikke – Kromosomrekkefølge som en fylogenetisk markør

Etter Stian hadde vi en annen masterstudent, Pia, som konsentrerte seg om et rent bioinformatisk tema i vår gruppe. Hun forsvarte i går sin avhandling med tittelen «Evaluating the Applicability of Macrosynteny as a Phylogenetic Trait Based on an Exploration of Spiralia» (Evaluering av makrosyntenis anvendbarhet som et […]

Mixing the genome or not – Chromosome order as a phylogenetic marker

After Stian, we had another Master student, Pia, who concentrated on a purely bioinformatic topic in our group. She successfully defend here thesis with the title “Evaluating the Applicability of Macrosynteny as a Phylogenetic Trait Based on an Exploration of Spiralia” yesterday. Like Stian, Pia is also moving […]

Den unormale oppførselen til mitokondrielle genomer hos bukhårsdyr

Susanna forsvarte sin masteroppgave med suksess forrige uke. I prosjektet sitt ønsket hun å undersøke utviklingen av mitokondriell genomrekkefølge hos bukhårsdyr (Gastrotricha). Gastrotricha er svært små og flate dyr, som vanligvis ikke er lengre enn 1 mm. Likevel kan de ha svært delikate strukturer på huden i form […]

The unduly behavior of the mitochondrial genomes of hairybellies

Susanna successfully defended her Master thesis last week. In her project, she wanted to address the evolution of the mitochondrial genome order of hairybellies (Gastrotricha). Gastrotricha are very tiny and flat animals, which are usually not longer than 1 mm. Nonetheless, they can have very delicate structures on […]

Hva er det neste som skjer med smådyrene?

I forrige uke publiserte vi en artikkel om meiofauna og hvorfor det er viktig å studere dem, og hvilke vitenskapelige spørsmål som bør tas opp i neste omgang. Artikkelen «Fundamental questions in meiofauna research highlight how small but ubiquitous animals can improve our understanding of Nature» ble publisert […]

What’s up next for the small animals?

Last week, we published an paper on meiofauna and why it is important to study them and which scientific questions should be addressed next. The paper “Fundamental questions in meiofauna research highlight how small but ubiquitous animals can improve our understanding of Nature” was published in Communications Biology. […]

Group of the month: Cycliophora – the ringbearers and the “Norwegian” phylum

This month I will present to you a very small phylum of animals – both in size and in number of species. The phylum Cycliophora, which means the ring-bearer, comprises exactly one genus and two described species. These species are about 350 µm in body length, which is […]

Månedens gruppe: Cycliophora – ringbærerne og den «norske» fylumet

Denne måneden vil jeg presentere en svært liten dyregruppe – både i størrelse og i antall arter. Cycliophora, som betyr ringbærer, består av nøyaktig én slekt og to beskrevne arter. Disse artene er ca. 350 µm i kroppslengde, noe som er mindre enn en halv millimeter og omtrent […]

Genomics of the small stuff – getting it done

As mentioned in the first calendar door of our advents calendar this year, genomics of small animals is challenging. Yesterday, Nhu Dinh successfully finished her Master thesis but she also experienced some of the challenges related to the small animals and genomics. The problem is that some of […]

Genomikk i det små – å få det gjort

Som nevnt i den første kalenderluken i årets adventskalender, er genomikk av smådyr utfordrende. I går ble Nhu Dinh ferdig med masteroppgaven sin, men hun fikk også erfare noen av utfordringene knyttet til smådyr og genomikk. Problemet er at noen av dem er så små og har så […]

Årets siste forsvar – med suksess

Denne uken var den siste hele uken før juleferien, hvor alle går på sin velfortjente ferie. Men til tross for at det har vært en rolig uke på museet, var det en stor dag for Nhu Dinh i dag. Hun forsvarte nemlig masteroppgaven sin i dag. Gratulerer Nhu […]

The last defense of the year – successfully

This week was the last full week before the Christmas break where everybody goes on their well deserved holidays. However, despite all the slowing down at the museum this week, today was a big day for Nhu Dinh. She successfully defended her Master thesis today. Congratulations Nhu Dinh. […]

Door 8: Erasmus – exchange of knowledge across Europe

CEG has a long standing tradition of hosting Erasmus students for an internship. This year we also had two students visiting us from Sardinia during the summer. “Erasmus+ is the EU’s program to support education, training, youth and sport in Europe.” It is a program that facilities knowledge […]

Dør 8: Erasmus – utveksling av kunnskap på tvers av Europa

CEG har en lang tradisjon for å være vertskap for Erasmus-studenter på praksisopphold. I år hadde vi også to studenter på besøk fra Sardinia i løpet av sommeren. «Erasmus+ er EUs program for å støtte utdanning, opplæring, ungdom og idrett i Europa.» Det er et program som legger […]

Door 1: Quo vadis biodiversity genomic research?

It is the time of the year, where our group opens a door at our advents calendar again. It is my turn to open the first door. Our group is involved in many research projects involving genomic data as you can see when looking at our previous posts. […]

Dør 1: Quo vadis genomisk forskning på biologisk mangfold?

Det er den tiden på året hvor gruppen vår åpner en dør i adventskalenderen vår igjen. Det er min tur til å åpne den første døren. Gruppen vår er involvert i mange forskningsprosjekter som involverer genomdata, som du kan se når du ser på de tidligere innleggene våre. […]

CEG with an even stronger commitment to Norwegian Biosystematics

After an already strong commitment to Norwegian Biodiversity Genomics earlier this year, CEG showed an even stronger commitment to Norwegian Biosystematics at the first ever “Norsk symposium i biosystematikk” organized by Artsdatankena and the Natural History Museum last week in Oslo. With 10 out of 49 contributed talks […]

CEG med enda sterkere satsing på norsk biosystematikk

Etter et allerede sterkt engasjement for norsk biodiversitetsgenomikk tidligere i år, viste CEG et enda sterkere engasjement for norsk biosystematikk på tidenes første «Norsk symposium i biosystematikk» som ble arrangert av Artsdatankena og Naturhistorisk Museum i Oslo forrige uke. Med 10 av 49 foredrag og “flash talks” bidro […]

Better together: Scientists from 33 European countries join forces to generate reference genomes for the continent’s rich biodiversity.

The European Reference Genome Atlas (ERGA) Pilot Project reports its success in uniting researchers from across Europe to produce high-quality reference genomes for 98 species. This continental effort is setting the stage for a new, inclusive and equitable model for biodiversity genomics. This resulted in several publications, which […]