Door 19: New paper out: Insight into the phylogeny of the intertidal beetle genus Aegialites (Coleoptera, Salpingidae).

Published in Zoologica Scripta: link here. The paper named “Insight into the phylogeny of the intertidal beetle genus Aegialites (Coleoptera, Salpingidae)“, by Marianne N. Haugen, Vladimir I. Gusarov, Derek S. Sikes & Torsten H. Struck is now published in Zoologica Scripta. This paper, which is an important part […]

Door 12: Is AI the solution to overcome the challenges in sequencing genomes?

In 2018, Lewin et al proposed the ambitious goal to sequence a reference genome of each eukaryotic species on Earth within 10 years called the moonshot of biology. This proposal let to the establishment of the Earth Biogenome Project (EBP) and gained a lot of traction and momentum […]

Dør 12: Er KI løsningen for å overvinne utfordringene ved sekvensering av genomer?

I 2018 foreslo Lewin et al det ambisiøse målet å sekvensere et referansegenom for hver eukaryotisk art på jorden innen 10 år, kalt «moonshot of biology». Dette forslaget førte til etableringen av Earth Biogenome Project (EBP), som fikk stor oppmerksomhet og fart i etterkant. Dette førte til etableringen […]

The second of its kind – reference genome of a lamp shall

A couple of days ago we published the genome of a brachiopod species, in specific Discradisca antillarum in the journal G3. Brachiopods are a group of shelled, filter-feeding marine invertebrates also known as lamp shalls. Though they superficially resemble bivalve mollusks, brachiopods are not. Brachiopods have the shells […]

Den andre i sitt slag – referansegenomet til en armfoting

For et par dager siden publiserte vi genomet til en armfotinger, nærmere bestemt Discradisca antillarum, i tidsskriftet G3. Brakiopoder er en gruppe skallede, filterfôrende marine virvelløse dyr, også kjent som armfotinger. Selv om de overfladisk ligner på muslinger, er brakiopoder ikke det. Brakiopoder har skall på rygg- og […]

Månedens gruppe: Begermarker (Kamptozoa eller Entoprocta)

Rekke Entoprocta (også kalt Kamptozoa) er kjent som begermark. Globalt er det kjent 260 arter til dags dato, og 30 i Norge. Individene er små, med en kroppsstørrelse på 0,5–7 mm. Imidlertid bygger andre arter, i tillegg til solitære arter, kolonier som kan bli opptil 25 cm store. […]

Blanding av genomet eller ikke – Kromosomrekkefølge som en fylogenetisk markør

Etter Stian hadde vi en annen masterstudent, Pia, som konsentrerte seg om et rent bioinformatisk tema i vår gruppe. Hun forsvarte i går sin avhandling med tittelen «Evaluating the Applicability of Macrosynteny as a Phylogenetic Trait Based on an Exploration of Spiralia» (Evaluering av makrosyntenis anvendbarhet som et […]

Mixing the genome or not – Chromosome order as a phylogenetic marker

After Stian, we had another Master student, Pia, who concentrated on a purely bioinformatic topic in our group. She successfully defend here thesis with the title “Evaluating the Applicability of Macrosynteny as a Phylogenetic Trait Based on an Exploration of Spiralia” yesterday. Like Stian, Pia is also moving […]

Group of the month, May: The Krill

Featured photo: Euphausia superba, the Antarctic krill. Photo by Professor Dr. habil. Uwe Kils, uploaded to en.wikipedia.org. This file is licensed under the Creative Commons Attribution-Share Alike 3.0 Unported license. https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/ Tiny but mighty, krill are among the most abundant animals on Earth and their collective role is […]

Den unormale oppførselen til mitokondrielle genomer hos bukhårsdyr

Susanna forsvarte sin masteroppgave med suksess forrige uke. I prosjektet sitt ønsket hun å undersøke utviklingen av mitokondriell genomrekkefølge hos bukhårsdyr (Gastrotricha). Gastrotricha er svært små og flate dyr, som vanligvis ikke er lengre enn 1 mm. Likevel kan de ha svært delikate strukturer på huden i form […]

The unduly behavior of the mitochondrial genomes of hairybellies

Susanna successfully defended her Master thesis last week. In her project, she wanted to address the evolution of the mitochondrial genome order of hairybellies (Gastrotricha). Gastrotricha are very tiny and flat animals, which are usually not longer than 1 mm. Nonetheless, they can have very delicate structures on […]

Hva er det neste som skjer med smådyrene?

I forrige uke publiserte vi en artikkel om meiofauna og hvorfor det er viktig å studere dem, og hvilke vitenskapelige spørsmål som bør tas opp i neste omgang. Artikkelen «Fundamental questions in meiofauna research highlight how small but ubiquitous animals can improve our understanding of Nature» ble publisert […]

What’s up next for the small animals?

Last week, we published an paper on meiofauna and why it is important to study them and which scientific questions should be addressed next. The paper “Fundamental questions in meiofauna research highlight how small but ubiquitous animals can improve our understanding of Nature” was published in Communications Biology. […]

Successfully served the European biodiversity genomic community

The Biodiversity Genomics Europe (BGE) Project is a community-driven effort funded by the EU to establish a framework for coordinating DNA barcoding and genome sequencing across Europe. As part of the genome stream of BGE, reference genomes from species from critical European biodiversity are sequenced. An important task […]

Vellykket betjening av det europeiske samfunnet for genomisk biodiversitet

Biodiversity Genomics Europe (BGE) er et fellesskapsdrevet prosjekt finansiert av EU for å etablere et rammeverk for koordinering av DNA-strekkoding og genomsekvensering i hele Europa. Som en del av genomstrømmen i BGE sekvenseres referansegenomer fra arter fra kritisk europeisk biologisk mangfold. En viktig oppgave i dette arbeidet var […]

Door 23: Struggles, Setbacks & Solutions

I’m three out of four semesters deep into an MSc, meaning that in a few short months I will be delivering a completed thesis, with detailed results and an in-depth discussion. I’ve had a timeline laid out since the very beginning and am largely on track. That isn’t […]

Genomics of the small stuff – getting it done

As mentioned in the first calendar door of our advents calendar this year, genomics of small animals is challenging. Yesterday, Nhu Dinh successfully finished her Master thesis but she also experienced some of the challenges related to the small animals and genomics. The problem is that some of […]

Genomikk i det små – å få det gjort

Som nevnt i den første kalenderluken i årets adventskalender, er genomikk av smådyr utfordrende. I går ble Nhu Dinh ferdig med masteroppgaven sin, men hun fikk også erfare noen av utfordringene knyttet til smådyr og genomikk. Problemet er at noen av dem er så små og har så […]

Årets siste forsvar – med suksess

Denne uken var den siste hele uken før juleferien, hvor alle går på sin velfortjente ferie. Men til tross for at det har vært en rolig uke på museet, var det en stor dag for Nhu Dinh i dag. Hun forsvarte nemlig masteroppgaven sin i dag. Gratulerer Nhu […]

The last defense of the year – successfully

This week was the last full week before the Christmas break where everybody goes on their well deserved holidays. However, despite all the slowing down at the museum this week, today was a big day for Nhu Dinh. She successfully defended her Master thesis today. Congratulations Nhu Dinh. […]

Door 15: CEG involvement in the European BGE genome sequencing project

CEG research group members Torsten Struck and myself are coordinating the task of Community Sampling, within WP5 of the the EU-funded BioGenomics Europe project. We have now completed our task, well before the deadline of February 2025 set by BGE. Our task began with annoucing two public calls, […]

Door 9: Divergence by isolation in Marine Mammals – the case of Kangia ringed seals

Cover: Picture by Greenland Institute of Natural Resources When I need to take a break from work, I often stroll around the Oslo Natural History Museum. Zoological collections have always fascinated me since I was a child, and now that I work for one of them I`m able […]

Door 8: Erasmus – exchange of knowledge across Europe

CEG has a long standing tradition of hosting Erasmus students for an internship. This year we also had two students visiting us from Sardinia during the summer. “Erasmus+ is the EU’s program to support education, training, youth and sport in Europe.” It is a program that facilities knowledge […]

Dør 8: Erasmus – utveksling av kunnskap på tvers av Europa

CEG har en lang tradisjon for å være vertskap for Erasmus-studenter på praksisopphold. I år hadde vi også to studenter på besøk fra Sardinia i løpet av sommeren. «Erasmus+ er EUs program for å støtte utdanning, opplæring, ungdom og idrett i Europa.» Det er et program som legger […]

Door 6: Tiny Zooplankton with Giant Genetic Mysteries

For our 6th door, I want to introduce you to a puzzling aspect of my favorite study organism, Calanus—a group of tiny marine zooplankton that play a crucial role in the North Atlantic and Arctic ecosystems. These crustaceans, no larger than a grain of rice, sustain our oceans and […]